דוח מעבדה ביוכימיה א במתכונת החדשה כולל הערות מנחה

תקציר העבודה

ממן 12- דו"ח מעבדה בקורס ביוכימיה א(20204) במתכונת החדשה שהחלה ב-2017א. הממן כולל הערות מנחה- ציון 90 הדו"ח מעבדה כולל שני חלקים. חלק א של בידוד הליזוזים וחלק ב בו קבענו את פעילות הליזוזים, הניצולת, דרגת הניקוי והפעילות הספציפית שלו.
הדו"ח מפורט וברור. הוא כולל תשובות לכל השאלות והמטלות שבממ"ן. בנוסף, הוא כולל טבלאות מתאימות, גרפים וניתוח תוצאות. הדוח במבנה דוח מעבדה וכולל מטרה, שיטות וחומרים, תוצאות, דיון וסיכום. ביוכימיה א במתכונת חדשה שם המעבדה:
בידוד האנזים ליזוזים מחלבון של ביצת תרנגולת.
מטרה:
בידוד ליזוזים מחלבון ביצת תרנגולת בשיטת כרומטוגרפיית מחליף קטיונים ומציאת המקטעים בהן מצוי ליזוזים בדרגת ניקוי גבוהה בהשוואה לאחרים. שיטות וחומרים:
במעבדה זו השתמשנו בשתי שיטות:
1.      ספקטרוסקופיה- הספקטרוסקופיה עוסקת בחקר הקשר בין קרינה אלקטרומגנטית לבין חומר. באמצעות קרינה אלקטרומגנטית עוברת אנרגיה ממערכת אחת, הפולטת אותה, אל מערכת אחרת, הבולעת אותה. המכשיר שבו משתמשים למדידת בליעה של קרינה ע"י חומר נקרא ספקטרופוטומטר. הוא מודד את ההבדל בין עוצמת הקרינה הנכנסת לתמיסה הנבדקת לבין עוצמת הקרינה היוצאת ממנה, בתחום האור הנראה והאולטרה סגול. את התוצאות הוא מוסר ביחידות O.D=Log(I1/I2)= A= צפיפות אופטית (I1- עוצמת האור הפוגע, I2- עוצמת האור היוצא). במהלך הניסוי התבקשנו לבדוק את ריכוזו של הליזוזים בכול אחת מהפרקציות. כדי למצוא את ריכוזי הליזוזים[l1] , ביצענו ניסוי מקדים בו בדקנו באמצעות ספקטרופוטומטר את ערכי הבליעה באורך גל 280 ננומטר בריכוזים ידועים של חלבון אלבומין מסרום השור(חלבון BSA). השתמשנו באורך גל זה מאחר וחלבונים מכילים חומצות אמיניות ארומטיות הבולעות אור באורך גל של 280 ננומטר. מנתונים אלו יצרנו עקומת כיול המתארת את ערכי הבליעה כפונקציה של ריכוז חלבון הBSA. את המקטעים השונים שהתקבלו בכרומטוגרפיה בדקנו גם כן בספקטרופוטומטר באמצעות הצבת נתוני הבליעה שהתקבלו בכול מקטע בעקומת הכיול של חלבון ה-BSA. כך למעשה קבענו את ריכוז הליזוזים במקטעים השונים(מאחר והשכיחות של שיירי החומצות האמיניות הארומטיות בחלבון BSA דומה לשכיחותן בליזוזים, ניתן להשתמש בעקומת הכיול של BSA עבור הליזוזים).
חלק נוסף בניסוי שבו השתמשנו בספקטרופוטומטר היה החלק שבו קבענו את פעילות הליזוזים במקטעים השונים. בכול מבחנה התרחשה ריאקצית אנזים- סובסטרט, כאשר בכול מבחנה הייתה דגימה ממקטע אחר+תמיסת חיידקים שהאנזים אמור לפרק את הדופן שלהם. בכול מבחנה בדקנו את ערך הבליעה באורך גל 450 ננומטר מאחר ותמיסת החיידקים עכורה ולכן בליעת האור שם היא בתחום האור הנראה. עכירות התמיסה יורדת תוך פירוק דופן החיידקים והפעילות האנזימטית פרופורציונית לקצב ירידת הבליעה של תמיסת הסובסטרט באורך גל של 450 ננומטר.

2 .      כרומטוגרפיית חילופי יונים- מחליף קטיונים:
כרומטוגרפיית חילופי יונים מנצלת הבדלים בסימן ובגודל של המטען-
[l1]לא.
ריכוז חלבון כללי (2-)