עולם הנגיפים. ציון: 81 (עם הערות)

תקציר העבודה

העבודה עוסקת בעולם הנגיפים: יחידות יוצרות מוקדים, תרחיף, בקטריופאז'ים, ליזיס, חיידקים, גידול חד שלבי, זמן חביון, תקופת עלייה, תקופת רגיעה, יעילות הדבקה, עירוב פנוטיפי, עירוב גנוטיפי, נגיף, ווירון, אנדוציטוזה, שפעת, חלבון המאגלוטינין, מסלול ליטי, פלאקים, מסלול ליזוגני, פתוגניים, טרנדוקציה כללית, סלקציה, מוטנטים, רקומבינציה ועוד.
עבודת הגשה ממ"ן 11 בקורס עולם הנגיפים 20292
הוכנה ע"י סטודנטית לתואר ראשון במדעי החיים, האוניברסיטה הפתוחה- בעלת בגרות 5
יח"ל בכימיה. ציון הממ"ן 81
ממ"ן 11- עולם הנגיפים שאלה מספר 1
א. כדי לבדוק את מספר היחידות יוצרות מוקדים למ"ל של תרחיף בקטיופאז'ים- מדגירים דגימה מתרחיף מהול של בקטריופאז'ים עם דגימה מתרבית צפופה של חיידקים ומפזרים את התערובת על צלחת עם אגר. בתנאים אלה פאז' שתוקף חיידק בודד גורם להמסתו תוך שחרור כמאה פאז'ים, שכל אחד מהם מסוגל להמיס חיידק בעקבות מחזור הדבקה נוסף וכן הלאה. לאחר שעות אחדות של חזרה על תהליך זה נוצרים על גבי מרבד החיידקים מוקדי ההרס- אותם אזורים נראים לעין שבהם התמוססו החיידקים. כל מוקד מייצג "מושבה" של נגיפים שנוצרה מנגיף אחד. ספירת המוקדים מאפשרת לקבוע את מספר יחידות ההדבקה יוצרות המוקדים- שהן יחידות הריכוז המקובלות ביותר לתיאור תרחיף של נגיפים. האגר משמש מצע לגידול וגם כולל וגם כולל דגימה נוספת של חיידקים לא מודבקים, שנועדה להבטיח שיווצר מרבד חיידקים, שכן החיידקים המודבקים בדגימה הראשונה כבר לא יתרבו.
החיידקים המודבקים  יעברו ליזיס וישחררו בקטריופאזים אשר יוכלו להדביק רק חיידקים שכנים בגלל נוכחות אגר המונעת את הדיפוסיה שלהם למקומות מרוחקים. ערבוב התערובת על צלחת פטרי שמכילה מצע מזון מוצק. התערובת של האגר, הפאז'ים והחיידקים מתפזרת על פני הצלחת ומתמצקת בשכבה דקה. לאחר מכן מתמוססים החיידקים המודבקים וכמה מאות צאצאים של כל פאז' פורצים ומדביקים חיידקים שכנים וחוזר חלילה. במקביל לתהליך ההדבקה ממשיכים החיידקים (שניצלו מהנגיפים) להתחלק ולהתרבות, עד שהם מכסים את כל הצלחת כמרבד אטום. אחרי כ-24 שעות של הדגרה, ניתן לראות עיגולים צלולים שבולטים על רקע המרבד הצפוף של החיידקים- מוקדי הרס.
ב.
ריבוב הדבקה  (multiplicity of infection – MOI)הוא היחס בין מספר נגיפי החיידקים שיוצרים מוקדים לבין מספר התאים שבתרחיף. ככל שהערך של MOI נמוך יותר, כך רבים יותר התאים בתרחיף שיודבקו במספר מועט יותר של נגיפים וככל שהערך של MOI גבוה-